Г-н Варданян входит в Советы директоров целого ряда компаний: ОАО «АвтоВАЗ» (крупнейшего автопроизводителя в Восточной Европе), ОАО «КАМАЗ» (крупнейшего производителя грузовых автомобилей в Восточной Европе), ОАО «НОВАТЭК» (крупнейшего в России независимого производителя природного газа), ЗАО «СИБУР Холдинг» (лидера нефтехимии России и Восточной Европы), ОАО «Росгосстрах» (крупнейшей в России страховой компании), объединенной компании «Интегра» и «ГЕОТЕК Холдинг» (высокотехнологичной нефтесервисной группы и лидера российского рынка сейсморазведки) и Standard Bank Plc (одного из мировых лидеров сферы финансовых и банковских услуг на развивающихся рынках), а также возглавляет Совет директоров «АмериаБанка», ведущего банка Армении. В июне 2010 г. компания Joule Unlimited, Inc. (пионер в области производства жидкого топлива из солнечной энергии) включила Рубена Варданяна в свой Совет директоров. В августе 2011 года Рубен был избран председателем Совета директоров ОАО «Российская венчурная компания» (государственного фонда фондов и института развития Российской Федерации) как независимый директор.
В рамках своего членства в Советах директоров г-н Варданян возглавляет Комитет по кадрам и вознаграждениям ОАО «АвтоВАЗ», Комитет по корпоративному управлению и компенсациям ОАО «НОВАТЭК», а также является членом Комитета по кадрам и вознаграждениям ОАО «КАМАЗ» и Комитета по аудиту ОАО «НОВАТЭК».
C 2002 по 2004 год являлся генеральным директором ОАО «Росгосстрах», с апреля 2004 по июль 2005 года занимал пост председателя Совета директоров компании. В 2005–2009 годах являлся председателем Совета директоров ЗАО «Гражданские самолеты Сухого». В 2006-2009 годах входил в Совет директоров ОАО КБ «АК БАРС» (крупнейшего банка Республики Татарстан) и являлся членом Комитета по кадрам и вознаграждениям банка.